Un studiu genomic al ciupercilor care trăiesc pe pielea noastră oferă un cadru pentru înțelegerea modului în care acești microbi contribuie la sănătatea și bolile pielii.
Comunități complexe de microbi trăiesc la suprafața corpului nostru. Aceste ciuperci, bacterii și viruși sunt cunoscute în mod colectiv sub numele de microbiom al pielii. O echipă de la Institutul Național de Cercetare a Genomului Uman (NHGRI) al NIH și Institutul Național al Cancerului (NCI) a folosit anterior tehnici genomice pentru a studia bacteriile pielii. Au găsit diverse comunități bacteriene care au variat între oameni și după locul pielii. În noul lor studiu, echipa a folosit o abordare genomică similară pentru a înțelege mai bine ciupercile care trăiesc pe pielea noastră.
Ciupercile includ mucegaiuri, ciuperci și drojdie care sunt folosite pentru fermentarea pâinii și a berii. Acești microbi au fost asociați cu multe boli și afecțiuni ale pielii, inclusiv piciorul atletului, eczemele, mătreața și infecțiile unghiilor de la picioare. Infecțiile fungice ale pielii afectează aproximativ 29 de milioane de persoane la nivel național. Ciupercile pot fi însă lente și dificil de cultivat în laboratoare, făcând infecțiile fungice greu de identificat și tratat.
pe 22 mai 2013, oamenii de știință au colectat probe la 14 locuri ale corpului de la 10 adulți sănătoși. Aceștia s-au concentrat pe un fragment de ADN împărțit de toți ciupercile - distanțierul transcris 1 intermediar (ITS1) al ARN ribozomal - care ar putea fi folosit pentru clasificarea ciupercilor la nivelul genului cu o precizie mai mare de 97%.
Prin generarea a peste 5 milioane de secvențe ITS1 din probe, echipa a reușit să identifice peste 80 de tipuri de ciuperci la nivel de gen care trăiesc pe pielea umană. În schimb, metodele tradiționale de cultivare ar putea identifica doar 18 tipuri. au fost găsite la toate zonele pielii. au fost tipul predominant pe 11 din cele 14 locuri, inclusiv în spatele urechilor, în nări, pe spate și pe brațe.
Echipa a descoperit că tocurile, care nu prezintă o diversitate bacteriană extinsă, erau cel mai complex site pentru ciuperci, cu aproximativ 80 de tipuri reprezentate. Pânzele de la degetele de la picioare, cu aproximativ 60 de tipuri, și unghiile de la picioare, cu 40, aveau următoarele niveluri înalte de diversitate fungică. Mâinile și brațele, care adăpostesc o mare diversitate de bacterii, aveau relativ puține tipuri de ciuperci. Comunitățile fungice de pe corpul de bază au fost destul de stabile în timp, cu puține modificări atunci când au fost testate cu o distanță de până la 3 luni. În schimb, ciupercile de pe picioare s-au modificat considerabil în decurs de 3 luni, reflectând probabil o expunere mai mare la mediu.
Comunitățile fungice de pe corpul uman sunt complexe și specifice locului ”, spune co-autorul dr. Heidi Kong de la NCI. Obținând o conștientizare mai completă a ecosistemelor fungice și bacteriene, putem aborda mai bine bolile de piele asociate, inclusiv infecțiile fungice, care pot fi legate de tratamentele împotriva cancerului.
Datele din studiul nostru ne oferă o linie de bază despre indivizii normali pe care nu i-am mai avut până acum ”, spune co-autorul dr. Julie Segre de la NHGRI. Concluzia este că picioarele tale sunt pline de diversitate fungică, așa că poartă șlapii în vestiare dacă nu vrei să îți amesteci ciupercile piciorului cu ciupercile altcuiva.
